间质瘤绝大多数由局部炎症逐步发展成的恶性肿瘤：
所有的胃间质瘤患者，都是存在着长期胃炎的过程（无论是有没有感觉），患者随着胃炎的进展和胃粘膜免疫功能自我修复漫长的反复过程中，间质瘤细胞形成并且进展。
直肠间质瘤和食道间质瘤的患者，都曾经存在着炎症，内痔，发炎的经历和过程。
肠道外间质瘤的形成有着不确定的，许多的因素形成的，大部分患者的肿瘤体积膨大。有的肿瘤其实存在着一根与原发灶部位联系的蒂，而被誤诊为肠道外间质瘤。
间质瘤是一种间叶性生长的，往腔外部延伸生长的，对胃肠道缺乏反应的肿瘤：
所有的胃肠道内部位的间质瘤，在肿瘤大小2-5公分的时，肿瘤是在器官壁内生长的，即使是当肿瘤体积逐渐増大，质量加重，肿瘤逐渐往腔外部迁移，最终完全脱离器官。像一个葫芦似的蒂垂吊在腹腔内，并且紧密地固定于周边器官，肠系膜，大网膜。由于肿瘤生长初期，只是间叶性占据器官壁，对器官内的空间不能形成堵塞效应，即使是垂吊在器官外，肠道内空间依然是畅通无阻的，患者在没有影像检查下，基本没有感觉的间质瘤正在悄无声息地生长。除了溃疡面的隐血，失血造成人体逐渐消瘦；溃疡面大面积出血，造成明显的便血现象；患者才感觉到了大事不妙。
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